Неудобно и неестественно, что при перемещении нода он не становится выделенным

Стереотип: двигаю нод и меняю его свойства, но фактически меняются свойства другого нода, т.к. перемещаемый не стал выделенным, активным.

Очень даже удобно :-)

Не согласна с Вами: выделенный узел автоматически помещается в центр, и смысла тогда в перетаскивании нет. Оно нужно для того, чтобы карта лучше (нагляднее, понятнее) выглядела. А для того, чтобы редактировать узлы, нужно на них кликнуть - и это вполне мнемонично.